Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AmfrQ9R049 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms