Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms