Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms