Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms