Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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