Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tuba8Q9JJZ2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms