Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gfra4Q9JJT2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms