Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms