Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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Rb1cc1Q9ESK9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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