Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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