Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms