Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Capn12Q9ER56 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Capn12Q9ER56 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Capn12Q9ER56 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Capn12Q9ER56 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Capn12Q9ER56 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn12Q9ER56 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms