Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms