Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mmp1bQ9EPL6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms