Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hmg20aQ9DC33 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hmg20aQ9DC33 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hmg20aQ9DC33 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hmg20aQ9DC33 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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