Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccdc97Q9DBT3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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