Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp12Q9D9M2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms