Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms