Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm5Q9D7I9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm5Q9D7I9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms