Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gbe1Q9D6Y9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gbe1Q9D6Y9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.7 ms