Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc9bQ9D6E4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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