Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms