Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms