Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms