Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmed11Q9D2R4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms