Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms