Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms