Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ChtopQ9CY57 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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