Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx7Q9CY18 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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