Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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