Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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