Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkrip1Q9CWV6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms