Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms