Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms