Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms