Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms