Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ndufa3Q9CQ91 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ndufa3Q9CQ91 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms