Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms