Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup155Q99P88 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms