Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms