Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl43Q99N89 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms