Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rcbtb2Q99LJ7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rcbtb2Q99LJ7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rcbtb2Q99LJ7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rcbtb2Q99LJ7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rcbtb2Q99LJ7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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