Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms