Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms