Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TirapQ99JY1 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms