Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pacsin3Q99JB8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pacsin3Q99JB8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pacsin3Q99JB8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pacsin3Q99JB8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pacsin3Q99JB8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pacsin3Q99JB8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms