Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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