Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms