Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Rnf144aQ925F3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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