Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim7Q923T7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trim7Q923T7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim7Q923T7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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